Alors, je peux pas répondre à tout, mais une chose est certaine, tu n'auras pas deux pistes séparées, mais bien une seule avec ton son des deux guitares mélangés.
Ça, c'est certain. Il n'y a aucune raison que ton ordi repère quelle partie du signal provient de quelle guitare.
Après, est-ce que c'est possible... J'ai peur que ça crée quelques problèmes, un peu comme quand on essaie de mettre deux grattes sur le même ampli. Comme les deux grattes ont pas les mêmes niveaux de sorties, tu risques d'en entendre une plus forte que l'autre, et bien sûr, impossible de changer ça après l'enregistrement. La seule solution étant de changer le volume sonore avec les potards de la gratte.
Mais... je pense qu'il vaut bien mieux enregistrer une gratte après l'autre, puis faire un rapide montage, doit bien y avoir des logiciels pour le faire, ça, non ?