Je ne sais pas quels sont les risques, mais de toutes façons tu n'auras quasiment pas de son en passant par l'entrée micro, quand à la sortie enceinte PC, effectivement ça risque de les griller (a cause des fréquences).
Perso j'utilise une interface USB (environs 50€) type:
http://www.musicafond.fr/behringer-interface-guitare-ucg102-prID=2080.html
maintenant tu dois en trouver avec des prix plus bas, mais il faut chercher sur le net.
avec cette interface tu n'a quasiment pas de latence, de plus c'est livré avec 3 simulateur d'amplis, ensuite tu peux utiliser des soft qui sont compatible avec cette interface, du genre amplitube, guitar rig, etc, et la c'est vraiment le pied, grace au preset, tu peux trouver les sons de tes guitares heroes.
De plus cette interface est reconnue par cubase, ableton live, etc.
donc pour faire de la compo en MAO c'est une petite merveille.